Луковичные - крепкие, сильные растения, при соблюдении всех правил агротехники они мало болеют. Основные принципы: не высаживать луковицы на сырья участках и на тяжелой почве без ее предварительного улучшения; сажать не ранее чем через 3-4 года после внесения свежего навоза; не применять в избыточны дозах азот; ежегодно выкапывать луковицы тюльпанов и гиацинтов; при выкапывании и посадке выбраковывать поврежденные луковицы; удалять и уничтожать больные растения вместе с корнями и листьями, а еще лучше - с комом земли; не допускать сильного загущения посадок; систематически удалять сорняки, а также растительные остатки, глубоко перекапывать почву перед посадкой луковиц. 
Грибковые и бактериальные заболевания 
Наибольший вред луковичным наносят грибные и бактериальные заболевания: ризоктониоз, тифулез, склеротиниоз, фузариоз, бактериальная мокрая гниль. Они поражают тюльпаны, нарциссы, крокусы, мускари. 
Признаки болезней: пятна, налет спор на листьях и луковицах, гнили. Для профилактики грибковых и бактериальных болезней луковицы перед посадкой обрабатывают растворами медьсодержащих препаратов, перманганата калия или 10 минут выдерживают е горячей воде (50-55°С). 
Вирусные болезни 
Серьезный вред наносят вирусные болезни, вызывающие изменение окраски и деформацию цветков. Наиболее опасна пестролепестность, поражающая тюльпаны. Сорта при этом постепенно вырождаются. Вирус распространяется с соком больных растений, а переносят его тли, трипсы, цикадки, клопы, белокрылки и другие насекомые. 
Поскольку массовое появление этих вредителей наблюдается во второй половине мая, то и поражаются пестролелестностью главным образом сорта среднего и позднего сроков цветения. Иногда заражение происходит через режущие инструменты при срезке цветов. Для предупреждения заболеваний нужно бороться с переносчиками вирусных болезней, соблюдать культурооборот, своевременно удалять и уничтожать пораженные растения.
Вредители
Луковичные, цветущие весной, хороши тем, что в период их вегетации вредителей еще мало. Однако они есть. Особенно опасен корневой луковый клещ, поражающий многие луковичные цветы. Самки откладывают яйца на луковицы, внутрь вредитель проникает через донце, выгрызает ходы в луковицах, они загнивают. Рост пораженных растений замедляется, листья желтеют и отмирают.
Для профилактики после луковичных полезно высаживать бархатцы, пиретрум. Для нарциссов опасна нарциссовая муха. Ее личинки проникают в луковицу и питаются сочными чешуями. Луковицы становятся мягкими, издают неприятный запах, загнивают. В период вегетации листья увядают и засыхают. 
Луковичным вредят также хрущи (личинки майских жуков) и проволочники. Меры борьбы с ними - глубокая перекопка почвы, удаление сорняков. Цветочными луковицами любят лакомиться мыши, особенно привлекательны для них крокусы. Однако луковицы нарциссов мыши не трогают, на этом основан простой метод защиты: по периметру луковичные обсаживают нарциссами. Еще один способ - укрытие посадок пластиковой сеткой (ее края пришпиливают к земле).